分子篩效應是當含有多種分子成分的樣品溶液緩慢地流經凝 膠色譜柱時，各分子在柱內同時進行著兩種 不同的運動，垂直向下的移動和無定向的擴 散運動。大分子物質由于直徑較大，不易進 入凝膠顆粒的微孔中，而分布于顆粒之間， 在洗脫時移動的速度較快；小分子物質除了 可在凝膠顆粒間隙中擴散外，還可以進入凝膠顆粒的微孔中，即進入凝膠相內，在向下 移動的過程中，從一個凝膠內擴散到顆粒間 隙后再進入另一凝膠顆粒，如此不斷地進入和擴散，因此，小分子物質的下移速度要落后于大分子物質，從而使樣品中分子大的先 流出色譜柱，中等分子的后流出，分子最小 的最后流出，這種現象叫分子篩效應。
    一個含有各種分子的樣品溶液緩慢地流經凝膠色譜柱時，各分子在柱內同時進行著兩種不同的運動：垂直向下的移動和無定向的擴散運動。大分子物質由于直徑較大，不易進入凝膠顆粒的微孔，而只能分布顆粒之間，所以在洗脫時向下移動的速度較快。小分子物質除了可在凝膠顆粒間隙中擴散外，還可以進入凝膠顆粒的微孔中，即進入凝膠相內，在向下移動的過程中，從一個凝膠內擴散到顆粒間隙后再進入另一凝膠顆粒，如此不斷地進入和擴散，小分子物質的下移速度落后于大分子物質，從而使樣品中大的分子先流出色譜柱，中等的分子后流出，小分子最后流出，這種現象叫分子篩效應。
    具有多孔的凝膠就是分子篩。各種分子篩的孔隙大小分布有一定范圍，有最大極限和最小極限。分子直徑比凝膠最大孔隙直徑大的，就會全部被排阻在凝膠顆粒之外，這種情況叫全排阻。兩種全排阻的分子即使大小不同，也不能有分離效果。直徑比凝膠最小孔直徑小的分子能進入凝膠的全部孔隙。如果兩種分子都能全部進入凝膠孔隙，即使它們的大小有差別，也不會有好的分離效果。因此，一定的分子篩有它一定的使用范圍。